Полицейский кролик Джуди и лис Ник расследуют появление таинственной рептилии, чей приезд в Зверополис вызывает настоящий переполох и кардинально меняет привычный уклад жизни мегаполиса. Загадочное существо оставляет за собой след, который приводит героев к необходимости действовать скрытно, чтобы выйти на след преступника.
Для успешного раскрытия этого сложного дела Джуди и Нику приходится работать под прикрытием, распределившись по разным районам Зверополиса. Каждый из них погружается в свою среду, собирая улики и информацию, которая должна помочь разгадать головоломку и восстановить порядок в городе.